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title: "Áreas de Estudo"
author: "Projeto Boto-Cinza"
output:
  flexdashboard::flex_dashboard:
    theme: paper
    source_code: embed
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```{r setup, include=FALSE}
library(dplyr) 
library(leaflet)  
library(sf)
library(stringr)
library(htmlwidgets)
library(htmlTable)

pasta_proj <- rprojroot::find_rstudio_root_file()

arquivo_area <- paste0(pasta_proj, "/1_data/SHAPES_AUX/Areas_PBC.shp")
arquivo_rota <- paste0(pasta_proj, "/1_data/SHAPES_AUX/Rotas_PBC.shp")
arquivo_pnto <- paste0(pasta_proj, "/1_data/SHAPES_AUX/Pontos_PBC.shp")

area_cru <- st_read(arquivo_area)
rota_cru <- st_read(arquivo_rota)
pnto_cru <- st_read(arquivo_pnto)

areas <- area_cru %>%
  filter(Tipo == "Area")  %>%
  st_make_valid () %>%
  mutate(Rota = c(2,3,1,2,2,1,1), 
         Area = round(as.double(st_area(geometry)/1000^2),1),
         Comp = 0,
         Estacao = 0) %>%
  select(Linha, Rota, Area, Comp, Tipo, Estacao, geometry)


rotas <- 
rota_cru %>%
  filter(Tipo == "Pesquisa") %>%
  st_make_valid() %>%
  mutate(Comp = round(as.double(st_length(geometry)/1000), 1), 
         Area = 0,
         Estacao = 0) %>%
  select(Linha, Rota, Area, Comp, Tipo, Estacao, geometry)


rotas_embarc <- 
  rota_cru %>%
  filter(Tipo !="Pesquisa") %>%
  mutate(Comp = 0,
         Area = 0,
         Estacao = 0) %>%
  select(Linha, Rota, Area, Comp, Tipo, Estacao, geometry)


pontos <-
  pnto_cru %>% 
  filter(Linha == 3) %>%
  arrange(Estacoes) %>%
  mutate(geometry = st_cast(geometry,"POINT"),
         Estacao = Estacoes,
         Area = 0,
         Comp = 0,
         Tipo = "Pontos") %>% 
  select(Linha, Rota, Area, Comp, Tipo, Estacao, geometry)

data <- 
  bind_rows(areas, rotas, rotas_embarc, pontos) %>%
  select(7,1:6)

```


Mapas {data-icon="ion-stats-bars"}
=====================================  

Column {.sidebar data-width=200}
-------------------------------------

### Areas e Rotas

```{r}
data %>% as_tibble() %>% filter(Tipo == "Area", Linha %in% c("1","3")) %>% arrange(Linha,Rota) %>% select(1:3) %>% left_join(
  data %>% as_tibble() %>% filter(Tipo == "Pesquisa", Linha %in% c("1","3")) %>% arrange(Linha,Rota) %>% select(1,2,4), by = c("Linha", "Rota")) %>% select(-1) %>%
  addHtmlTableStyle(align = "l|c|c", 
                    css.cell = c("width: 100;","width: 100;","width: 100;")) %>%
  htmlTable(rgroup = c("Linhas 1 e 2", "Linha 3"),
            n.rgroup = c(3,2),
            rnames = FALSE)

```



Column {data-width=800}
-------------------------------------
    
### Mapa
    
```{r map}

pal_green <- colorNumeric(palette = "Greens",
                         domain = 5:0)

pal_lines <- colorFactor(palette = "viridis",
                         domain = c("Passeio",
                                    "Balsa",
                                    "Pesca"))

area_1 <- data %>% filter(Linha == 1, Tipo == "Area")
area_2 <- data %>% filter(Linha == 2, Tipo == "Area")
area_3 <- data %>% filter(Linha == 3, Tipo == "Area")
rota_1 <- data %>% filter(Linha == 1, Tipo == "Pesquisa")
rota_2 <- data %>% filter(Linha == 2, Tipo == "Pesquisa")
rota_pas <- data %>% filter(Tipo == "Passeio")
rota_bal <- data %>% filter(Tipo == "Balsa")
rota_pes <- data %>% filter(Tipo == "Pesca")
pnts <- data %>% filter(Estacao != 0)


leaflet() %>%
  addProviderTiles("Esri.WorldImagery") %>%
  addScaleBar(position = "bottomleft") %>%
  addPolygons(data = area_1, group = "Área de Estudo 1", weight = 2, color = ~pal_green(Rota)) %>%
  addPolygons(data = area_2, group = "Área de Estudo 2", weight = 2, color = ~pal_green(Rota)) %>%
  addPolygons(data = area_3, group = "Área de Estudo 3", weight = 2, color = ~pal_green(Rota)) %>%
  addPolylines(data = rota_1, group = "Rotas 1", weight = 2, color = ~pal_green(Rota)) %>%
  addPolylines(data = rota_2, group = "Rotas 2", weight = 2, color = ~pal_green(Rota)) %>%
  addPolylines(data = rota_pas, group = "Passeios", color = ~pal_lines(Tipo)) %>%
  addPolylines(data = rota_bal, group = "Balsa", color = ~pal_lines(Tipo)) %>%
  addPolylines(data = rota_pes, group = "Pesca", color = ~pal_lines(Tipo)) %>%
  addCircleMarkers(data = pnts, group = "Estações de Coleta", color = "blue", radius = 5) %>%
  addLayersControl(baseGroups = c("Área de Estudo 1",
                                  "Área de Estudo 2",
                                  "Área de Estudo 3",
                                  ""),
                   overlayGroups = c("Rotas 1",
                                     "Rotas 2",
                                     "Passeios",
                                     "Balsa",
                                     "Pesca",
                                     "Estações de Coleta")) %>%
  hideGroup(c("Área de Estudo 1",
              "Área de Estudo 2",
              "Área de Estudo 3",
              "Rotas 1",
              "Rotas 2",
              "Estações de Coleta",
              "Passeios",
              "Balsa",
              "Pesca")) %>%
  addMeasure(primaryLengthUnit = "kilometers",
             primaryAreaUnit = "sqmeters")


```

Information {data-orientation=rows data-icon="fa-info-circle"}
===================================== 


### Mais coisas

resumos?